Wie ich sehe bin bzw. war ich nicht der einzige mit dem Problem aber hab ne Lösung gefunden, welche jedenfalls bei mir funktioniert hat:
1. Erstellt euch einen Ordner mit dem Namen GW2 in eurem jeweiligen Verzeichnis.
2. Zieht die GW2Setup.exe in den Ordner.
3. Benennt die Datei in GW2.exe um.
4. Startet die .exe.
Nun Sollte das Spiel als Installiert erkannt werden vom Client und Patcht alles.
Hoffe es hilft noch anderen.
LG